#81 Through the Wire

研究所やプロジェクトの外部アドバイザー達とのオンサイトコミュニケーション、SfNポスター、 K99体験談、LLM課金、電子実験ノート談義など。論文はハエ嗅覚系における結合形成作業の“次元削減”、FlyWireの変化球について。 (10/27収録)

Show Notes (番組HP):

• NotebookLM
• 元ラボのポスドクのTweeprintとNotebookLM
• のBioRxiv
• Neural DynamicsのScientific Advisory Council
• Bernard Sabatini
• Peter Dayan
• Lin Tian
• Yao Chen
• Mark Anderman
• Jeremiah Cohen
• Jeremiah が内田さんのところでやった最後の仕事
• に対するPeter Dayanの文章："These data nicely muddy the theoretical waters"とかすごい (萩)
• Schultz と一緒に仕事してる
• Theoretical Neuroscience: Computational And Mathematical Modeling of Neural Systems
• SfNにプレリミナリーなアブスト
• Nathaniel Daw
• Illana Witten
• Fedexでポスター印刷するサービス
• SfNの特別割引がある(pdf)
• 元D-labの井上さん
• 千歳さんラボ
• PO: プログラムオフィサー
• K99: Pathway to Independence
• Kグラント
• Rutgersが燃えていたツイートの一例
• 五十嵐さんリターン回
• 毎月ミーティングやってるK99出そうとしている人向けのグループ：k99-peer-mentoring-group[at]googlegroups.com
• この前録った古館さん回
• スクールによってはOpenAIのChatGPT Eduが無料
• Cython
• Mex
• MatlabはバージョンのアップデートでForループが速くなった
• PyQt
• %##じゃなくて#%%ですね汗
• Neurodata Without Borders
• GitHubをラボノートブックに
• Benchling
• ELNの議論
• 最近のEvernote
• DP2
• DP5
• DP5はVISAは大丈夫そう

論文パート

• 論文１：Dimensionality reduction simplifies synaptic partner matching in an olfactory circuit
• Liqun Luoラボ
• 種による嗅覚系の違いと共通点に着目したレビュー。違いの原因に関するディスカッションは特に見つからず… (脇)
• 過去のSema2b発現量操作による軸索の投射経路操作の論文
• Toll発現量のグラデ―ションに関する論文
• この系で使われている軸索の誘導因子の例、例えばTeneurin
• マウスのHippocampusの激シブdevelopment論文
• この先報：Teneurinのやつ
• 宮道さんの昔の仕事
• 論文２：The fly connectome reveals a path to the effectome
• Jonathan Pillow
• FlyWire祭り
• Motor Cortex祭り
• BICCN祭り
• 2018年にデータ取得は終わっている
• Davi Bock (今はThe University of Vermont)
• Clay ReidのところでV1のEMリコンストラクションをやっていた
• Editorによる序文
• Flagship論文 1 2
• Neurotransmitterの推定 なぜかCellに先に出てた
• MorphologyからCell Typeの推定
• 構造から機能を推定
• Sebastian Seung
• FlyWireのゲーム
• EyeWire論文
• Anthony Movshon
• にボコられている動画
• Samsungにいった?
• Mala Murthy
• のトラッキングの仕事、例えばこれ
• JaneliaのFly Hemi Brain
• C Elegansのコネクトーム
• *2万5千はJaneliaのHemi Brain、今回は140,000.
• 8000個のCell Type
• *今回のハエはオスでは無くメス
• Instrumental Variableの論文
• 2021年のノーベル経済学賞
• 0.01%の”Pair”なので、ある細胞に対して他のニューロンが繋がっている確率としてはおよそ1%、と解釈するのが正しそう。 (萩)
• SVDはMatrixがNbyNかつsymmetric (Wij = Wji)のとき、eigenvector decompositionとSVDは数学的に完全に等価になります。なので要はSVD、という説明は間違ってなさそうです。(萩)
• Light Fieldでハエ全脳の活動を見る
• BuzsakiのLog-dynamicl brain
• Songさんのシナプス強度のLognormal分布
• 線虫で全細胞をイメージングしながらオプトで操作 普通にNatureでした(萩)
• DMDM
• IBL
• David Rowlandのツイート 1 2

Editorial Notes:

• NotebookLMがXのことをTwitterって言ってるのちょっとおもしろい (脇)

  K99は通ったわけではない(おそらく落ちてリビジョンする)ので、内容に関しては話半分できいておいて下さい。(萩)